Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEC24BO95487 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEC24BO95487 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms