Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCNKO75909 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCNKO75909 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCNKO75909 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCNKO75909 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCNKO75909 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCNKO75909 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCNKO75909 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCNKO75909 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCNKO75909 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCNKO75909 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCNKO75909 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCNKO75909 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCNKO75909 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCNKO75909 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCNKO75909 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCNKO75909 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCNKO75909 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCNKO75909 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCNKO75909 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCNKO75909 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCNKO75909 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCNKO75909 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCNKO75909 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCNKO75909 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCNKO75909 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCNKO75909 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCNKO75909 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCNKO75909 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCNKO75909 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCNKO75909 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCNKO75909 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCNKO75909 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCNKO75909 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCNKO75909 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCNKO75909 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCNKO75909 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCNKO75909 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCNKO75909 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCNKO75909 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCNKO75909 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCNKO75909 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCNKO75909 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCNKO75909 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCNKO75909 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCNKO75909 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCNKO75909 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCNKO75909 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCNKO75909 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCNKO75909 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCNKO75909 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCNKO75909 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCNKO75909 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCNKO75909 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCNKO75909 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCNKO75909 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCNKO75909 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCNKO75909 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCNKO75909 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCNKO75909 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCNKO75909 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCNKO75909 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCNKO75909 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCNKO75909 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCNKO75909 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCNKO75909 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCNKO75909 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCNKO75909 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCNKO75909 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCNKO75909 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCNKO75909 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCNKO75909 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCNKO75909 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCNKO75909 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCNKO75909 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCNKO75909 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCNKO75909 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCNKO75909 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCNKO75909 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCNKO75909 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCNKO75909 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCNKO75909 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCNKO75909 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCNKO75909 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCNKO75909 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCNKO75909 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCNKO75909 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCNKO75909 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCNKO75909 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCNKO75909 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCNKO75909 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCNKO75909 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCNKO75909 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCNKO75909 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCNKO75909 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCNKO75909 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCNKO75909 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCNKO75909 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCNKO75909 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCNKO75909 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms