Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX3O75364 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX3O75364 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX3O75364 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX3O75364 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX3O75364 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX3O75364 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX3O75364 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX3O75364 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX3O75364 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX3O75364 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX3O75364 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX3O75364 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX3O75364 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX3O75364 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX3O75364 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX3O75364 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX3O75364 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX3O75364 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX3O75364 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX3O75364 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX3O75364 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX3O75364 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX3O75364 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX3O75364 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX3O75364 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX3O75364 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX3O75364 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX3O75364 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX3O75364 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PITX3O75364 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX3O75364 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX3O75364 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX3O75364 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX3O75364 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX3O75364 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX3O75364 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX3O75364 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX3O75364 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX3O75364 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX3O75364 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX3O75364 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX3O75364 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX3O75364 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX3O75364 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX3O75364 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX3O75364 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX3O75364 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX3O75364 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX3O75364 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX3O75364 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX3O75364 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX3O75364 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX3O75364 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX3O75364 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX3O75364 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX3O75364 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX3O75364 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PITX3O75364 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX3O75364 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX3O75364 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX3O75364 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX3O75364 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX3O75364 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX3O75364 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX3O75364 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX3O75364 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX3O75364 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX3O75364 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX3O75364 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX3O75364 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX3O75364 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX3O75364 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX3O75364 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX3O75364 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX3O75364 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX3O75364 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX3O75364 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX3O75364 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX3O75364 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX3O75364 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX3O75364 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX3O75364 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX3O75364 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX3O75364 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX3O75364 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX3O75364 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX3O75364 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX3O75364 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX3O75364 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX3O75364 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITX3O75364 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX3O75364 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX3O75364 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX3O75364 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX3O75364 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX3O75364 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX3O75364 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX3O75364 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITX3O75364 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms