Protein–RNA interactions for Protein: O75293

GADD45B, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45BO75293 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GADD45BO75293 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GADD45BO75293 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GADD45BO75293 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GADD45BO75293 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GADD45BO75293 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GADD45BO75293 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GADD45BO75293 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GADD45BO75293 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GADD45BO75293 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GADD45BO75293 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GADD45BO75293 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GADD45BO75293 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GADD45BO75293 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GADD45BO75293 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GADD45BO75293 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GADD45BO75293 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GADD45BO75293 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GADD45BO75293 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GADD45BO75293 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GADD45BO75293 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GADD45BO75293 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GADD45BO75293 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GADD45BO75293 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GADD45BO75293 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GADD45BO75293 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GADD45BO75293 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GADD45BO75293 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GADD45BO75293 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GADD45BO75293 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GADD45BO75293 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GADD45BO75293 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GADD45BO75293 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GADD45BO75293 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GADD45BO75293 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GADD45BO75293 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GADD45BO75293 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GADD45BO75293 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GADD45BO75293 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GADD45BO75293 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GADD45BO75293 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GADD45BO75293 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GADD45BO75293 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GADD45BO75293 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GADD45BO75293 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GADD45BO75293 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GADD45BO75293 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GADD45BO75293 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GADD45BO75293 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GADD45BO75293 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GADD45BO75293 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GADD45BO75293 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GADD45BO75293 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GADD45BO75293 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GADD45BO75293 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GADD45BO75293 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GADD45BO75293 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GADD45BO75293 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GADD45BO75293 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GADD45BO75293 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GADD45BO75293 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GADD45BO75293 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GADD45BO75293 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GADD45BO75293 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GADD45BO75293 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GADD45BO75293 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GADD45BO75293 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GADD45BO75293 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GADD45BO75293 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GADD45BO75293 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms