Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAK2O60296 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms