Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRKAB2O43741 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKAB2O43741 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms