Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HTATSF1O43719 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
HTATSF1O43719 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms