Protein–RNA interactions for Protein: O43633

CHMP2A, Charged multivesicular body protein 2a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2AO43633 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP2AO43633 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHMP2AO43633 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHMP2AO43633 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHMP2AO43633 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHMP2AO43633 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP2AO43633 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP2AO43633 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP2AO43633 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP2AO43633 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP2AO43633 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP2AO43633 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP2AO43633 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP2AO43633 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP2AO43633 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP2AO43633 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP2AO43633 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP2AO43633 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP2AO43633 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP2AO43633 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP2AO43633 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP2AO43633 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP2AO43633 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP2AO43633 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP2AO43633 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP2AO43633 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP2AO43633 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP2AO43633 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP2AO43633 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP2AO43633 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP2AO43633 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP2AO43633 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP2AO43633 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP2AO43633 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP2AO43633 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP2AO43633 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP2AO43633 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP2AO43633 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP2AO43633 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP2AO43633 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP2AO43633 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP2AO43633 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP2AO43633 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP2AO43633 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP2AO43633 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP2AO43633 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP2AO43633 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP2AO43633 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP2AO43633 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP2AO43633 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP2AO43633 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP2AO43633 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP2AO43633 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP2AO43633 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP2AO43633 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms