Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXA3O43365 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA3O43365 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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