Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ARPC1BO15143 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms