Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
ANKRD28O15084 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ANKRD28O15084 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms