Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CEP290O15078 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CEP290O15078 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CEP290O15078 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CEP290O15078 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CEP290O15078 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CEP290O15078 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CEP290O15078 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CEP290O15078 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CEP290O15078 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CEP290O15078 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CEP290O15078 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CEP290O15078 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CEP290O15078 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CEP290O15078 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CEP290O15078 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CEP290O15078 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CEP290O15078 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CEP290O15078 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CEP290O15078 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CEP290O15078 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CEP290O15078 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CEP290O15078 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CEP290O15078 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CEP290O15078 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CEP290O15078 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CEP290O15078 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CEP290O15078 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CEP290O15078 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CEP290O15078 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CEP290O15078 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CEP290O15078 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CEP290O15078 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CEP290O15078 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CEP290O15078 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CEP290O15078 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CEP290O15078 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CEP290O15078 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CEP290O15078 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CEP290O15078 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CEP290O15078 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CEP290O15078 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CEP290O15078 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CEP290O15078 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CEP290O15078 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CEP290O15078 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
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CEP290O15078 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CEP290O15078 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CEP290O15078 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CEP290O15078 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CEP290O15078 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CEP290O15078 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CEP290O15078 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
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CEP290O15078 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CEP290O15078 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CEP290O15078 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
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CEP290O15078 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
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CEP290O15078 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CEP290O15078 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CEP290O15078 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CEP290O15078 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CEP290O15078 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CEP290O15078 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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CEP290O15078 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CEP290O15078 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CEP290O15078 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CEP290O15078 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CEP290O15078 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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CEP290O15078 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CEP290O15078 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CEP290O15078 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CEP290O15078 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CEP290O15078 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CEP290O15078 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CEP290O15078 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CEP290O15078 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CEP290O15078 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CEP290O15078 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CEP290O15078 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CEP290O15078 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CEP290O15078 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CEP290O15078 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CEP290O15078 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CEP290O15078 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CEP290O15078 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CEP290O15078 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CEP290O15078 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CEP290O15078 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CEP290O15078 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CEP290O15078 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CEP290O15078 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CEP290O15078 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
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