Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYNMO15061 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYNMO15061 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYNMO15061 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYNMO15061 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYNMO15061 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYNMO15061 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYNMO15061 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SYNMO15061 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SYNMO15061 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYNMO15061 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SYNMO15061 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYNMO15061 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYNMO15061 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYNMO15061 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SYNMO15061 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SYNMO15061 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYNMO15061 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYNMO15061 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYNMO15061 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYNMO15061 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SYNMO15061 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYNMO15061 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYNMO15061 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYNMO15061 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYNMO15061 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYNMO15061 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYNMO15061 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYNMO15061 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYNMO15061 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYNMO15061 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYNMO15061 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYNMO15061 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYNMO15061 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYNMO15061 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYNMO15061 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYNMO15061 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SYNMO15061 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
SYNMO15061 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
SYNMO15061 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
SYNMO15061 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SYNMO15061 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SYNMO15061 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SYNMO15061 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SYNMO15061 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
SYNMO15061 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
SYNMO15061 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SYNMO15061 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SYNMO15061 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
SYNMO15061 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SYNMO15061 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SYNMO15061 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SYNMO15061 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SYNMO15061 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SYNMO15061 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SYNMO15061 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
SYNMO15061 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SYNMO15061 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SYNMO15061 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SYNMO15061 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SYNMO15061 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SYNMO15061 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SYNMO15061 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SYNMO15061 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SYNMO15061 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SYNMO15061 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SYNMO15061 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SYNMO15061 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SYNMO15061 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SYNMO15061 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SYNMO15061 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SYNMO15061 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SYNMO15061 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYNMO15061 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYNMO15061 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYNMO15061 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYNMO15061 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYNMO15061 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYNMO15061 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SYNMO15061 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYNMO15061 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYNMO15061 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYNMO15061 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SYNMO15061 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYNMO15061 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYNMO15061 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYNMO15061 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYNMO15061 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYNMO15061 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYNMO15061 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYNMO15061 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYNMO15061 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYNMO15061 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYNMO15061 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYNMO15061 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYNMO15061 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYNMO15061 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYNMO15061 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYNMO15061 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYNMO15061 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms