Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BHLHE40O14503 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHLHE40O14503 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms