Protein–RNA interactions for Protein: O00628

PEX7, Peroxisomal targeting signal 2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX7O00628 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEX7O00628 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEX7O00628 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEX7O00628 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEX7O00628 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEX7O00628 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEX7O00628 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEX7O00628 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEX7O00628 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEX7O00628 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEX7O00628 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEX7O00628 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEX7O00628 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEX7O00628 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEX7O00628 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEX7O00628 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PEX7O00628 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PEX7O00628 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEX7O00628 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEX7O00628 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEX7O00628 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEX7O00628 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEX7O00628 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEX7O00628 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEX7O00628 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEX7O00628 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEX7O00628 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEX7O00628 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEX7O00628 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEX7O00628 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PEX7O00628 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEX7O00628 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEX7O00628 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEX7O00628 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEX7O00628 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEX7O00628 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEX7O00628 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEX7O00628 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEX7O00628 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEX7O00628 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEX7O00628 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEX7O00628 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEX7O00628 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEX7O00628 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEX7O00628 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEX7O00628 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEX7O00628 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEX7O00628 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEX7O00628 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEX7O00628 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PEX7O00628 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEX7O00628 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PEX7O00628 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEX7O00628 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEX7O00628 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEX7O00628 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEX7O00628 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEX7O00628 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEX7O00628 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEX7O00628 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEX7O00628 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEX7O00628 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEX7O00628 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEX7O00628 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PEX7O00628 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEX7O00628 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEX7O00628 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEX7O00628 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PEX7O00628 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEX7O00628 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PEX7O00628 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEX7O00628 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEX7O00628 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEX7O00628 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEX7O00628 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEX7O00628 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEX7O00628 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEX7O00628 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEX7O00628 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PEX7O00628 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEX7O00628 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PEX7O00628 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEX7O00628 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEX7O00628 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEX7O00628 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEX7O00628 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEX7O00628 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEX7O00628 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEX7O00628 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEX7O00628 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEX7O00628 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEX7O00628 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PEX7O00628 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX7O00628 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX7O00628 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX7O00628 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX7O00628 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX7O00628 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX7O00628 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PEX7O00628 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms