Protein–RNA interactions for Protein: O00592

PODXL, Podocalyxin, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXLO00592 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PODXLO00592 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PODXLO00592 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PODXLO00592 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PODXLO00592 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PODXLO00592 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PODXLO00592 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PODXLO00592 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PODXLO00592 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PODXLO00592 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PODXLO00592 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PODXLO00592 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PODXLO00592 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PODXLO00592 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PODXLO00592 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PODXLO00592 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PODXLO00592 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PODXLO00592 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PODXLO00592 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PODXLO00592 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PODXLO00592 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PODXLO00592 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PODXLO00592 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PODXLO00592 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PODXLO00592 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PODXLO00592 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PODXLO00592 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PODXLO00592 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PODXLO00592 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PODXLO00592 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PODXLO00592 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PODXLO00592 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PODXLO00592 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PODXLO00592 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PODXLO00592 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PODXLO00592 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PODXLO00592 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PODXLO00592 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PODXLO00592 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PODXLO00592 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PODXLO00592 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PODXLO00592 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PODXLO00592 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PODXLO00592 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PODXLO00592 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PODXLO00592 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PODXLO00592 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PODXLO00592 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PODXLO00592 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PODXLO00592 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PODXLO00592 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PODXLO00592 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PODXLO00592 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PODXLO00592 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PODXLO00592 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PODXLO00592 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PODXLO00592 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PODXLO00592 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PODXLO00592 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PODXLO00592 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PODXLO00592 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PODXLO00592 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PODXLO00592 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PODXLO00592 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PODXLO00592 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PODXLO00592 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PODXLO00592 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PODXLO00592 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PODXLO00592 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PODXLO00592 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PODXLO00592 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PODXLO00592 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PODXLO00592 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PODXLO00592 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PODXLO00592 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PODXLO00592 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PODXLO00592 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PODXLO00592 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PODXLO00592 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PODXLO00592 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PODXLO00592 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PODXLO00592 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PODXLO00592 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PODXLO00592 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PODXLO00592 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PODXLO00592 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PODXLO00592 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PODXLO00592 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PODXLO00592 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PODXLO00592 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PODXLO00592 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PODXLO00592 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PODXLO00592 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PODXLO00592 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PODXLO00592 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PODXLO00592 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PODXLO00592 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PODXLO00592 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PODXLO00592 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PODXLO00592 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms