Protein–RNA interactions for Protein: O00329

PIK3CD, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CDO00329 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIK3CDO00329 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3CDO00329 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms