Protein–RNA interactions for Protein: J3KR12

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KR12 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
J3KR12 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
J3KR12 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
J3KR12 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
J3KR12 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
J3KR12 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
J3KR12 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
J3KR12 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
J3KR12 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
J3KR12 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
J3KR12 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
J3KR12 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
J3KR12 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
J3KR12 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
J3KR12 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
J3KR12 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
J3KR12 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
J3KR12 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
J3KR12 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
J3KR12 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
J3KR12 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
J3KR12 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
J3KR12 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
J3KR12 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
J3KR12 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
J3KR12 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
J3KR12 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
J3KR12 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
J3KR12 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
J3KR12 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
J3KR12 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
J3KR12 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
J3KR12 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
J3KR12 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
J3KR12 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
J3KR12 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
J3KR12 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
J3KR12 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
J3KR12 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
J3KR12 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
J3KR12 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
J3KR12 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
J3KR12 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
J3KR12 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
J3KR12 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
J3KR12 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
J3KR12 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
J3KR12 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
J3KR12 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
J3KR12 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
J3KR12 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
J3KR12 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
J3KR12 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
J3KR12 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
J3KR12 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
J3KR12 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
J3KR12 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
J3KR12 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
J3KR12 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
J3KR12 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
J3KR12 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
J3KR12 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
J3KR12 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
J3KR12 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
J3KR12 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
J3KR12 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
J3KR12 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3KR12 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3KR12 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3KR12 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3KR12 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3KR12 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3KR12 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3KR12 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3KR12 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3KR12 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3KR12 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3KR12 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3KR12 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3KR12 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3KR12 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3KR12 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3KR12 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3KR12 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3KR12 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3KR12 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3KR12 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3KR12 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3KR12 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3KR12 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3KR12 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3KR12 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3KR12 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
J3KR12 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
J3KR12 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
J3KR12 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3KR12 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3KR12 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3KR12 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
J3KR12 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms