Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERVV-1B6SEH8 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERVV-1B6SEH8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms