Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TTLL13PA6NNM8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms