Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SERINC4A6NH21 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERINC4A6NH21 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERINC4A6NH21 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SERINC4A6NH21 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERINC4A6NH21 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERINC4A6NH21 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERINC4A6NH21 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERINC4A6NH21 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERINC4A6NH21 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERINC4A6NH21 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERINC4A6NH21 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERINC4A6NH21 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERINC4A6NH21 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERINC4A6NH21 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERINC4A6NH21 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERINC4A6NH21 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SERINC4A6NH21 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERINC4A6NH21 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERINC4A6NH21 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERINC4A6NH21 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SERINC4A6NH21 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERINC4A6NH21 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERINC4A6NH21 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERINC4A6NH21 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERINC4A6NH21 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERINC4A6NH21 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERINC4A6NH21 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERINC4A6NH21 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERINC4A6NH21 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERINC4A6NH21 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERINC4A6NH21 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERINC4A6NH21 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SERINC4A6NH21 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERINC4A6NH21 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERINC4A6NH21 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERINC4A6NH21 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERINC4A6NH21 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERINC4A6NH21 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERINC4A6NH21 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERINC4A6NH21 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERINC4A6NH21 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SERINC4A6NH21 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERINC4A6NH21 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERINC4A6NH21 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERINC4A6NH21 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SERINC4A6NH21 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERINC4A6NH21 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERINC4A6NH21 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERINC4A6NH21 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERINC4A6NH21 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERINC4A6NH21 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERINC4A6NH21 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERINC4A6NH21 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERINC4A6NH21 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERINC4A6NH21 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERINC4A6NH21 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERINC4A6NH21 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SERINC4A6NH21 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERINC4A6NH21 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERINC4A6NH21 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERINC4A6NH21 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERINC4A6NH21 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERINC4A6NH21 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SERINC4A6NH21 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERINC4A6NH21 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERINC4A6NH21 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERINC4A6NH21 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERINC4A6NH21 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERINC4A6NH21 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERINC4A6NH21 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SERINC4A6NH21 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERINC4A6NH21 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SERINC4A6NH21 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERINC4A6NH21 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERINC4A6NH21 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERINC4A6NH21 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERINC4A6NH21 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERINC4A6NH21 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERINC4A6NH21 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERINC4A6NH21 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERINC4A6NH21 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERINC4A6NH21 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERINC4A6NH21 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERINC4A6NH21 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SERINC4A6NH21 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERINC4A6NH21 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERINC4A6NH21 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERINC4A6NH21 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERINC4A6NH21 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERINC4A6NH21 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERINC4A6NH21 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERINC4A6NH21 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERINC4A6NH21 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERINC4A6NH21 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SERINC4A6NH21 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERINC4A6NH21 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERINC4A6NH21 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERINC4A6NH21 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SERINC4A6NH21 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms