Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HELTA6NFD8 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HELTA6NFD8 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms