Protein–RNA interactions for Protein: A6NCQ9

RNF222, RING finger protein 222, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF222A6NCQ9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF222A6NCQ9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms