Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI5

LINC00862, Putative transmembrane protein encoded by LINC00862, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00862A6NCI5 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00862A6NCI5 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00862A6NCI5 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms