Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
MAP1LC3B2A6NCE7 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MAP1LC3B2A6NCE7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms