Protein–RNA interactions for Protein: A5A3E0

POTEF, POTE ankyrin domain family member F, humanhuman

Predictions only

Length 1,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEFA5A3E0 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23■■□□□ 1.27
POTEFA5A3E0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POTEFA5A3E0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POTEFA5A3E0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
POTEFA5A3E0 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
POTEFA5A3E0 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POTEFA5A3E0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POTEFA5A3E0 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
POTEFA5A3E0 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23■■□□□ 1.27
POTEFA5A3E0 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
POTEFA5A3E0 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
POTEFA5A3E0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
POTEFA5A3E0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POTEFA5A3E0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
POTEFA5A3E0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
POTEFA5A3E0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POTEFA5A3E0 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POTEFA5A3E0 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
POTEFA5A3E0 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POTEFA5A3E0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POTEFA5A3E0 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POTEFA5A3E0 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POTEFA5A3E0 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POTEFA5A3E0 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POTEFA5A3E0 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POTEFA5A3E0 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POTEFA5A3E0 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POTEFA5A3E0 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POTEFA5A3E0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POTEFA5A3E0 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POTEFA5A3E0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POTEFA5A3E0 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POTEFA5A3E0 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POTEFA5A3E0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POTEFA5A3E0 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POTEFA5A3E0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POTEFA5A3E0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POTEFA5A3E0 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
POTEFA5A3E0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POTEFA5A3E0 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POTEFA5A3E0 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POTEFA5A3E0 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POTEFA5A3E0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POTEFA5A3E0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POTEFA5A3E0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POTEFA5A3E0 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POTEFA5A3E0 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POTEFA5A3E0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POTEFA5A3E0 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POTEFA5A3E0 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POTEFA5A3E0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POTEFA5A3E0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POTEFA5A3E0 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POTEFA5A3E0 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POTEFA5A3E0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POTEFA5A3E0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POTEFA5A3E0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POTEFA5A3E0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POTEFA5A3E0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POTEFA5A3E0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POTEFA5A3E0 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POTEFA5A3E0 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POTEFA5A3E0 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POTEFA5A3E0 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POTEFA5A3E0 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POTEFA5A3E0 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POTEFA5A3E0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POTEFA5A3E0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POTEFA5A3E0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POTEFA5A3E0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POTEFA5A3E0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
POTEFA5A3E0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POTEFA5A3E0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POTEFA5A3E0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POTEFA5A3E0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POTEFA5A3E0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POTEFA5A3E0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POTEFA5A3E0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms