Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
IRGMA1A4Y4 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRGMA1A4Y4 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms