Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WW87

IGKV2-40, Immunoglobulin kappa variable 2-40, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV2-40A0A087WW87 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IGKV2-40A0A087WW87 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IGKV2-40A0A087WW87 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IGKV2-40A0A087WW87 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IGKV2-40A0A087WW87 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IGKV2-40A0A087WW87 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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IGKV2-40A0A087WW87 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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IGKV2-40A0A087WW87 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IGKV2-40A0A087WW87 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15□□□□□ -0.01
IGKV2-40A0A087WW87 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IGKV2-40A0A087WW87 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IGKV2-40A0A087WW87 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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IGKV2-40A0A087WW87 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
IGKV2-40A0A087WW87 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
IGKV2-40A0A087WW87 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
IGKV2-40A0A087WW87 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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