Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 RASGEF1B-214ENST00000638048 2386 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 AC009237.3-203ENST00000442128 3551 ntBASIC9□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 CR1-206ENST00000400960 6959 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 DOCK2-211ENST00000520908 4654 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 GABRA1-211ENST00000635880 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 ZNF438-208ENST00000538351 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 FBXO30-201ENST00000237281 9009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 LMO7-207ENST00000465261 5580 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 TRMT10A-202ENST00000394876 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 TCL6-206ENST00000467865 3663 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 LINC01114-201ENST00000421071 482 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 CST12P-201ENST00000457644 362 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 FAM107B-217ENST00000478076 790 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 AC011632.2-201ENST00000520696 738 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 C3orf14-207ENST00000542214 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 AC007639.1-201ENST00000577281 833 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 AC018793.2-201ENST00000639584 585 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 RAB11A-201ENST00000261890 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 LINC01991-202ENST00000446091 1524 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 UBE2V1-201ENST00000340309 2536 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 LRRC8B-203ENST00000439853 7474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 ZNF449-201ENST00000339249 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 SP110-201ENST00000258381 2426 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 ADAL-201ENST00000389651 1559 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 EPS8-213ENST00000543612 2965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 ZMYND8-221ENST00000619049 4027 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 NUP214-201ENST00000359428 7600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 AC020978.8-201ENST00000571975 3022 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 DEFB132-201ENST00000382376 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 PIGN-207ENST00000586566 3891 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 FREM1-204ENST00000422223 10086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 SLAMF1-202ENST00000302035 4006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 ZNF559-ZNF177-202ENST00000446085 2470 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 AL390726.6-201ENST00000637760 1654 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 LINC01762-201ENST00000423907 454 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 Z68868.1-201ENST00000429048 544 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 MORF4L1P5-201ENST00000433352 961 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 AP006216.1-201ENST00000439104 419 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 RPL5P11-201ENST00000498068 893 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 RPL7L1P4-201ENST00000513004 707 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 HAND2-AS1-233ENST00000515345 797 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 OR4A13P-201ENST00000529316 942 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 AP002370.2-201ENST00000531424 545 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 LINC02341-202ENST00000637462 1295 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 ZNF138-206ENST00000440598 2230 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 LINC01108-201ENST00000427276 3152 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 AC125238.2-201ENST00000430003 1440 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 ABI1-202ENST00000359188 3492 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 FAM168A-201ENST00000064778 7296 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 EIF3EP1-201ENST00000433978 1316 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 ZNF585B-203ENST00000527838 2732 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 HRH1-203ENST00000431010 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 PKP4-217ENST00000628904 3856 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 LINC01441-201ENST00000433766 2290 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 YIPF4-201ENST00000238831 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 CYP3A5-201ENST00000222982 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 CCNT1-201ENST00000261900 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 TRIM49-201ENST00000329758 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 AC135068.1-201ENST00000332663 1084 ntAPPRIS P1 BASIC8.97□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 GTF3AP1-201ENST00000416942 1004 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 AL353768.1-201ENST00000439872 487 ntTSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 TRIM49C-201ENST00000448984 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 ZNF331-203ENST00000449416 3817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 CFL1P4-201ENST00000451536 498 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 AC002553.3-201ENST00000453002 341 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 AC117395.1-201ENST00000487390 403 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 TPRX1P1-201ENST00000557620 319 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 AC073333.2-201ENST00000603589 769 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 AC104836.2-201ENST00000609675 1293 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 OR2A5-202ENST00000641693 8681 ntAPPRIS P1 BASIC8.97□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 AADACL3-201ENST00000359318 3662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 AL035530.2-201ENST00000607391 1675 ntTSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 FBXW10-202ENST00000308799 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 HTR2A-203ENST00000543956 4689 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 UBE4B-202ENST00000343090 5267 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 GART-204ENST00000381831 3490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 TMSB4XP4-201ENST00000323496 618 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 PCYT1B-201ENST00000356768 1289 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.8 ms