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| PTCH1 | Q13635 | AC009237.3-203 | ENST00000442128 | 3551 nt | BASIC | 9 | □□□□□ -0.97 | | |
| PTCH1 | Q13635 | CR1-206 | ENST00000400960 | 6959 nt | TSL 1 (best) BASIC | 9 | □□□□□ -0.97 | | |
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| PTCH1 | Q13635 | CCDC26-201 | ENST00000446592 | 1721 nt | TSL 1 (best) BASIC | 8.99 | □□□□□ -0.97 | | |
| PTCH1 | Q13635 | GABRA1-211 | ENST00000635880 | 1739 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 8.99 | □□□□□ -0.97 | | |
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| PTCH1 | Q13635 | FBXO30-201 | ENST00000237281 | 9009 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 8.99 | □□□□□ -0.97 | | |
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| PTCH1 | Q13635 | SLAMF1-202 | ENST00000302035 | 4006 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 8.98 | □□□□□ -0.97 | | |
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| PTCH1 | Q13635 | TRIM49C-201 | ENST00000448984 | 2163 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 8.97 | □□□□□ -0.97 | | |
| PTCH1 | Q13635 | ZNF331-203 | ENST00000449416 | 3817 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 8.97 | □□□□□ -0.97 | | |
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| PTCH1 | Q13635 | AC002553.3-201 | ENST00000453002 | 341 nt | BASIC | 8.97 | □□□□□ -0.97 | | |
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| PTCH1 | Q13635 | AC073333.2-201 | ENST00000603589 | 769 nt | BASIC | 8.97 | □□□□□ -0.97 | | |
| PTCH1 | Q13635 | AC104836.2-201 | ENST00000609675 | 1293 nt | TSL 1 (best) BASIC | 8.97 | □□□□□ -0.97 | | |
| PTCH1 | Q13635 | OR2A5-202 | ENST00000641693 | 8681 nt | APPRIS P1 BASIC | 8.97 | □□□□□ -0.97 | | |
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| PTCH1 | Q13635 | C11orf65-208 | ENST00000615746 | 2711 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 8.97 | □□□□□ -0.97 | | |
| PTCH1 | Q13635 | UBE4B-202 | ENST00000343090 | 5267 nt | TSL 1 (best) BASIC | 8.97 | □□□□□ -0.97 | | |
| PTCH1 | Q13635 | GART-204 | ENST00000381831 | 3490 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 8.97 | □□□□□ -0.97 | | |
| PTCH1 | Q13635 | TMSB4XP4-201 | ENST00000323496 | 618 nt | BASIC | 8.97 | □□□□□ -0.97 | | |
| PTCH1 | Q13635 | PCYT1B-201 | ENST00000356768 | 1289 nt | TSL 1 (best) BASIC | 8.97 | □□□□□ -0.97 | | |
| PTCH1 | Q13635 | RNU1-150P-201 | ENST00000362491 | 162 nt | BASIC | 8.97 | □□□□□ -0.97 | | |