Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC009120.4-201ENST00000564455 513 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 OCLM-201ENST00000574641 884 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 PCGEM1-202ENST00000606314 759 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 AC004448.4-210ENST00000610229 833 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 AC016590.3-201ENST00000611171 753 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 ZNF969P-201ENST00000510345 2341 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 TTC39B-208ENST00000512701 10483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 LINC00907-201ENST00000585627 3324 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 CCDC62-203ENST00000392440 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 GRIK2-205ENST00000369138 4921 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 ABI1-202ENST00000359188 3492 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 AC093225.1-201ENST00000506867 1408 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 HSPD1P9-201ENST00000420325 1636 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 ERC1-204ENST00000397203 9118 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 SERPINB11-205ENST00000544088 1846 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 AC009948.5-201ENST00000624360 4406 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
HOXD10P28358 CDYL2-207ENST00000570137 8159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 AP002004.1-203ENST00000531091 1768 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 LCP2-206ENST00000521416 1599 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 LINC01492-201ENST00000411575 3738 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 DCP1A-206ENST00000610213 5994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 ARID5B-201ENST00000279873 7891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 AL121949.2-201ENST00000403446 1548 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 CCL16-205ENST00000611905 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 VCAM1-204ENST00000370119 2483 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 LPAL2-203ENST00000454031 2498 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 CDH12-202ENST00000504376 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 ZNF235-201ENST00000291182 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 SNX25-202ENST00000504273 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 HDAC2-AS2-208ENST00000519104 2016 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 TRRAP-202ENST00000359863 12677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 TRPM6-204ENST00000449912 8244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 DEFA6-201ENST00000297436 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 SLC20A1P1-201ENST00000413906 956 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 AL807757.2-201ENST00000416455 779 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
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HOXD10P28358 CD33-203ENST00000421133 1023 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
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HOXD10P28358 OSTCP4-201ENST00000424397 449 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
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HOXD10P28358 LINC01618-201ENST00000514957 727 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
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HOXD10P28358 LINC01002-237ENST00000634025 555 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 TM9SF4-202ENST00000398022 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 PSD3-218ENST00000523619 8145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
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HOXD10P28358 CLCN3-209ENST00000513761 6692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
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HOXD10P28358 JAKMIP2-205ENST00000507386 5915 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
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HOXD10P28358 AC005821.1-203ENST00000577270 3145 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 LINC00960-202ENST00000492922 2126 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 WNK3-201ENST00000354646 11341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 RBBP4P4-201ENST00000398588 1289 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 BX284668.3-201ENST00000414128 882 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 RPL21P50-201ENST00000417698 477 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 LINC01393-201ENST00000419905 746 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 BRWD1P3-201ENST00000428816 390 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 AC239367.3-201ENST00000428996 814 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 AC007283.1-201ENST00000434645 445 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 Z98949.3-201ENST00000436423 472 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 XXYLT1-AS2-202ENST00000447975 784 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 AC044784.1-201ENST00000456526 677 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
HOXD10P28358 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
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