Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

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Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 MUC4-209ENST00000463781 17110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 MTMR7-201ENST00000180173 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 LINC00282-202ENST00000627246 4008 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 MRE11-201ENST00000323929 6897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 BMS1-201ENST00000374518 7753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 KRTAP6-2-201ENST00000334897 313 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 RNU1-47P-201ENST00000362966 163 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP263-201ENST00000363376 128 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 TRGV3-201ENST00000390346 537 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 LINC01799-201ENST00000411701 386 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 MEG8-201ENST00000414488 800 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AL807761.3-201ENST00000427833 329 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 LINC02088-201ENST00000428134 620 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AL353052.1-201ENST00000428673 818 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 LINC01865-202ENST00000436808 853 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AL022310.1-201ENST00000436974 690 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 WDR82P1-201ENST00000439836 939 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC123904.1-201ENST00000441072 368 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AL139135.2-201ENST00000445040 433 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC115989.1-202ENST00000452153 1150 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC007731.3-201ENST00000458154 446 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 ATP1B3-202ENST00000462082 837 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL505P-201ENST00000482644 293 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 FAM177A1P1-201ENST00000503598 473 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 LEF1-AS1-205ENST00000508286 444 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 ZFP42-202ENST00000509524 2480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC097515.1-202ENST00000511818 371 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 SCARNA20.3-201ENST00000516913 131 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 RN7SKP105-201ENST00000517192 314 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 POLB-211ENST00000521492 786 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 OR7E154P-201ENST00000525174 932 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC104031.1-201ENST00000527726 372 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC023078.5-201ENST00000528646 707 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AP000873.2-205ENST00000529031 435 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 OR4A6P-201ENST00000534364 970 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 HIF1A-AS2-201ENST00000554254 533 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL657P-201ENST00000582431 293 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 MIR4786-201ENST00000583954 80 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC016405.2-201ENST00000607393 312 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC027271.1-201ENST00000610270 610 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC130456.6-201ENST00000623745 765 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 LYG2-206ENST00000626374 650 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 OR51Q1-202ENST00000641085 1096 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 ANK2-203ENST00000394537 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 HERC4-202ENST00000373700 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 MFAP3L-203ENST00000393704 5827 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 FBXL13-201ENST00000313221 2744 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 CACNB4-269ENST00000638005 4615 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 NUP214-202ENST00000411637 7538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 GJA10-201ENST00000369352 1652 ntAPPRIS P2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 UGT2B7-205ENST00000622664 1532 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 FAR2-202ENST00000536681 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 TRRAP-201ENST00000355540 12590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 KCNIP4-202ENST00000382148 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 SLC12A6-201ENST00000290209 7286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 NXF2B-202ENST00000602195 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 NDFIP2-206ENST00000620924 2324 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 NXF2-202ENST00000625106 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC006042.3-201ENST00000454684 1469 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 NPIPB6-201ENST00000532254 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 STMND1-203ENST00000536551 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 GCSAML-211ENST00000623578 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC9.34□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 GINS4-201ENST00000276533 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 CYP4F30P-203ENST00000438109 2250 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 CEP85-201ENST00000252992 3935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 TMEM135-202ENST00000340353 3938 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 MYLK4-201ENST00000274643 5806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 MDM4-207ENST00000454264 9926 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 CDH2-202ENST00000399380 3737 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 ERVFRD-1-202ENST00000542862 3184 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 ZSCAN4-201ENST00000318203 2246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 C10orf67-204ENST00000636213 3981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 MT4-201ENST00000219162 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 FABP1-201ENST00000295834 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 DEFB124-201ENST00000317676 216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 CREM-213ENST00000374734 711 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 PCOTH-201ENST00000382133 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 SMARCA2-205ENST00000382183 1178 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 NPM1P46-201ENST00000399556 865 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 COX6A1P3-201ENST00000404167 293 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC022173.1-201ENST00000418554 577 ntTSL 4 BASIC9.34□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 AC012519.1-201ENST00000424588 610 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
CSPP1Q1MSJ5 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
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