Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 HSPD1P9-201ENST00000420325 1636 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
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COL4A6Q14031 COLGALT2-203ENST00000367521 4723 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
COL4A6Q14031 TNR-202ENST00000367674 12949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
COL4A6Q14031 NOS1-206ENST00000618760 12283 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
COL4A6Q14031 CNTN4-202ENST00000397461 5198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
COL4A6Q14031 NBPF3-202ENST00000318249 3591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
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COL4A6Q14031 MKKS-201ENST00000347364 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
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COL4A6Q14031 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
COL4A6Q14031 RGS6-215ENST00000554782 1110 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
COL4A6Q14031 FLVCR2-207ENST00000555027 938 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
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COL4A6Q14031 B4GALT4-207ENST00000467604 5794 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
COL4A6Q14031 ROBO2-201ENST00000332191 5437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
COL4A6Q14031 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
COL4A6Q14031 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
COL4A6Q14031 AC136624.1-201ENST00000400791 413 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
COL4A6Q14031 MARK2P12-201ENST00000420129 585 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
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