Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AC025419.1-207ENST00000546198 1072 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PTCH1Q13635 AC012038.2-201ENST00000553006 256 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PTCH1Q13635 AL357153.3-201ENST00000553982 611 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PTCH1Q13635 LINC00929-203ENST00000556213 713 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PTCH1Q13635 AC127522.1-201ENST00000560531 751 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PTCH1Q13635 ULK4P2-204ENST00000569682 798 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
PTCH1Q13635 AC004034.1-201ENST00000573260 510 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PTCH1Q13635 AC012370.2-201ENST00000597541 1080 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PTCH1Q13635 BNIP3P32-201ENST00000600015 554 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
PTCH1Q13635 SNHG5-219ENST00000623910 631 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PTCH1Q13635 ZNF778-207ENST00000620195 11031 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
PTCH1Q13635 NEDD9-208ENST00000504387 3211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
PTCH1Q13635 DUXAP8-203ENST00000437781 2398 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
PTCH1Q13635 STAMBP-201ENST00000339566 6277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
PTCH1Q13635 OR6J1-201ENST00000540461 4165 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
PTCH1Q13635 TBX15-201ENST00000207157 3492 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PTCH1Q13635 AL355306.2-201ENST00000635570 1542 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
PTCH1Q13635 WDPCP-204ENST00000409199 2466 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
PTCH1Q13635 TMC5-206ENST00000561503 2487 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
PTCH1Q13635 ZNFX1-204ENST00000396105 7371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PTCH1Q13635 HOOK3-201ENST00000307602 14398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PTCH1Q13635 ZMYM6-202ENST00000357182 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PTCH1Q13635 ERMARD-202ENST00000366772 2003 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
PTCH1Q13635 KIAA1217-204ENST00000376454 7381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PTCH1Q13635 ZSCAN5A-201ENST00000391713 3562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
PTCH1Q13635 ZNF451-204ENST00000370708 9478 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
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PTCH1Q13635 KLHL7-203ENST00000409689 3231 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
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PTCH1Q13635 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
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PTCH1Q13635 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
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PTCH1Q13635 BRDT-202ENST00000362005 3409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
PTCH1Q13635 GLRA3-201ENST00000274093 8770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 RNF145-205ENST00000518802 2603 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 AC018717.1-201ENST00000457712 1505 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 PPWD1-201ENST00000261308 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 PPWD1-214ENST00000535264 2195 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 HSD17B13-202ENST00000328546 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
PTCH1Q13635 ASAH1-267ENST00000637991 2399 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
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