Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 ZNF700-201ENST00000254321 2882 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRHP20396 RAB3GAP2-202ENST00000358951 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRHP20396 TCF20-202ENST00000359486 7410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRHP20396 CDH23-213ENST00000619887 4224 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRHP20396 SP140-201ENST00000343805 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRHP20396 RNF214-204ENST00000530849 2846 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRHP20396 TCTN3-207ENST00000614499 2739 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRHP20396 SIRPB2-201ENST00000359801 2642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRHP20396 ZNF816-206ENST00000444460 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRHP20396 CYP4F62P-202ENST00000439137 2144 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRHP20396 GNGT1-205ENST00000455502 1943 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRHP20396 CHD6-201ENST00000309279 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRHP20396 AL008638.6-201ENST00000623947 4254 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TRHP20396 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRHP20396 ZNF45-201ENST00000269973 3898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRHP20396 ATG9A-202ENST00000396761 3799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TRHP20396 AL008721.2-201ENST00000609475 3754 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TRHP20396 ARIH2-201ENST00000356401 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRHP20396 TRIM55-201ENST00000276573 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRHP20396 CRYZ-201ENST00000340866 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRHP20396 ZNF525-203ENST00000475179 1868 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRHP20396 CYP4A11-202ENST00000371904 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRHP20396 AL132640.2-201ENST00000559968 1698 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
TRHP20396 LINC02504-201ENST00000512241 4949 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRHP20396 FBXO38-201ENST00000296701 3680 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRHP20396 TFIP11-204ENST00000407690 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRHP20396 ABI1-201ENST00000346832 3289 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRHP20396 KIAA1644-201ENST00000381176 6751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRHP20396 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRHP20396 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
TRHP20396 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
TRHP20396 OR10R2-201ENST00000368152 1008 ntAPPRIS P2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRHP20396 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
TRHP20396 PKMP3-201ENST00000405497 715 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
TRHP20396 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
TRHP20396 AL137793.1-201ENST00000433734 599 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRHP20396 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRHP20396 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
TRHP20396 PHBP9-201ENST00000453578 825 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
TRHP20396 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRHP20396 RN7SL791P-201ENST00000467868 295 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
TRHP20396 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
TRHP20396 OR7E28P-201ENST00000505191 975 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
TRHP20396 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRHP20396 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
TRHP20396 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRHP20396 SRSF5-206ENST00000554021 567 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRHP20396 AL356017.1-201ENST00000556796 594 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRHP20396 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRHP20396 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRHP20396 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
TRHP20396 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRHP20396 RNF157-207ENST00000592271 755 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRHP20396 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
TRHP20396 AC244153.1-204ENST00000615582 401 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRHP20396 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
TRHP20396 AC073254.1-206ENST00000617813 907 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRHP20396 KIF4B-201ENST00000435029 4378 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRHP20396 IFNW1-201ENST00000380229 1932 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRHP20396 SELP-206ENST00000458599 1945 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRHP20396 Z95114.3-201ENST00000624395 1921 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
TRHP20396 DNAJC16-203ENST00000375849 3446 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRHP20396 PCSK1-201ENST00000311106 5086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRHP20396 PBX1-212ENST00000540236 6175 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRHP20396 GPATCH8-208ENST00000591680 4692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRHP20396 ZNF763-201ENST00000343949 2621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRHP20396 AP004243.1-201ENST00000529108 1433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRHP20396 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRHP20396 LYPD6B-202ENST00000409029 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRHP20396 UIMC1-211ENST00000510698 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TRHP20396 IL22RA1-201ENST00000270800 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRHP20396 LIPC-AS1-201ENST00000561083 2231 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRHP20396 PDIA6-203ENST00000404371 2682 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRHP20396 SYNPO2L-201ENST00000372873 4121 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRHP20396 FANCL-202ENST00000402135 1698 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRHP20396 LMO3-215ENST00000537304 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRHP20396 PBLD-202ENST00000309049 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRHP20396 PYGB-201ENST00000216962 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRHP20396 CDH1-214ENST00000621016 3304 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRHP20396 GALC-203ENST00000393569 2547 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRHP20396 ARHGEF4-201ENST00000326016 3666 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRHP20396 CASR-201ENST00000490131 4015 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRHP20396 ACAD10-220ENST00000549590 2888 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRHP20396 CDC42SE2-208ENST00000505065 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRHP20396 PARP9-205ENST00000477522 3128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRHP20396 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TRHP20396 RN7SKP118-201ENST00000364331 330 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TRHP20396 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TRHP20396 SULT1C2-204ENST00000409880 1206 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRHP20396 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TRHP20396 WDR82P1-201ENST00000439836 939 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TRHP20396 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRHP20396 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRHP20396 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRHP20396 AL109809.3-201ENST00000456875 246 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TRHP20396 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TRHP20396 RN7SL790P-201ENST00000474043 298 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TRHP20396 AC105918.1-201ENST00000474399 838 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TRHP20396 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TRHP20396 RPL7AP26-201ENST00000488538 813 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms