Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 PHIP-201ENST00000275034 10460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 OFD1P15Y-201ENST00000411536 1392 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 MAS1-201ENST00000252660 9841 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 ADGRB3-203ENST00000546190 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 PLN-201ENST00000357525 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 HPS5-205ENST00000438420 4147 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 AL731556.1-201ENST00000394628 3711 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 PZP-201ENST00000261336 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 CCL1-201ENST00000225842 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 OOSP1-201ENST00000398992 1270 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 PSMA6P1-201ENST00000400275 741 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 AL359885.1-201ENST00000415786 903 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 AL157884.1-201ENST00000424561 454 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 OSBPL10-AS1-203ENST00000428872 538 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 TIMM8BP2-201ENST00000445940 251 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
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VPS8Q8N3P4 CCNJP2-201ENST00000457810 1163 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 ZCCHC10-203ENST00000504170 325 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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VPS8Q8N3P4 RGS6-215ENST00000554782 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 AL355838.1-201ENST00000554814 559 ntTSL 4 BASIC10.09□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 GLYATL1P2-202ENST00000588046 902 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
VPS8Q8N3P4 AL589935.1-201ENST00000602418 488 ntTSL 4 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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VPS8Q8N3P4 Metazoa_SRP.38-201ENST00000615981 254 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
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VPS8Q8N3P4 RBBP4-202ENST00000373493 7943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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VPS8Q8N3P4 EIF4A2-205ENST00000440191 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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VPS8Q8N3P4 OR7E91P-202ENST00000642062 1198 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 LIMD1-201ENST00000273317 11331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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VPS8Q8N3P4 LINC01224-203ENST00000596283 2766 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 ZNF445-202ENST00000425708 10052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 AC125238.2-201ENST00000430003 1440 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 AL031651.1-201ENST00000615357 1438 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 GSTCD-201ENST00000360505 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 CDH12-201ENST00000382254 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 HDAC9-202ENST00000405010 4239 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 DIAPH3-206ENST00000465066 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 CSDE1-218ENST00000610726 4312 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 IL20-202ENST00000367098 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
VPS8Q8N3P4 TMEM170B-201ENST00000379426 8362 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.07□□□□□ -0.8
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