Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AC011525.1-201ENST00000562167 5676 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
TCOF1Q13428 OR4K13-203ENST00000641904 5684 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
TCOF1Q13428 RTN3-202ENST00000339997 4886 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
TCOF1Q13428 MAPK10-323ENST00000641493 3207 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
TCOF1Q13428 KAT14-201ENST00000377681 3483 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
TCOF1Q13428 ZSCAN12-202ENST00000396827 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
TCOF1Q13428 OR2M1P-201ENST00000318104 951 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
TCOF1Q13428 MTND2P12-201ENST00000417560 1252 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
TCOF1Q13428 AL122019.1-202ENST00000458070 546 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
TCOF1Q13428 RN7SL643P-201ENST00000471845 291 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
TCOF1Q13428 OR7E99P-201ENST00000505750 922 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
TCOF1Q13428 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
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TCOF1Q13428 UBE2N-204ENST00000549833 960 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
TCOF1Q13428 LINC00556-201ENST00000569603 412 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
TCOF1Q13428 AP005136.2-201ENST00000583253 1049 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
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TCOF1Q13428 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
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TCOF1Q13428 CAGE1-203ENST00000379918 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
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TCOF1Q13428 AC007993.1-201ENST00000621298 2430 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
TCOF1Q13428 CEP85L-204ENST00000392500 1872 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
TCOF1Q13428 P2RY14-202ENST00000424796 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
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TCOF1Q13428 SMG1P2-201ENST00000566127 4221 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
TCOF1Q13428 ZBTB40-201ENST00000374651 8368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
TCOF1Q13428 DGKK-201ENST00000611977 7407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
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TCOF1Q13428 NEDD4L-204ENST00000382850 8251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
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TCOF1Q13428 SPANXN5-201ENST00000375511 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
TCOF1Q13428 AGL-201ENST00000294724 7446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
TCOF1Q13428 MET-202ENST00000397752 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
TCOF1Q13428 NUMB-229ENST00000557597 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
TCOF1Q13428 USP50-203ENST00000532404 1386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
TCOF1Q13428 DHRS9-205ENST00000432060 1652 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
TCOF1Q13428 OR51M1-203ENST00000642046 4092 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
TCOF1Q13428 IKZF3-215ENST00000535189 1996 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
TCOF1Q13428 SLC20A1P1-201ENST00000413906 956 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
TCOF1Q13428 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
TCOF1Q13428 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
TCOF1Q13428 AL590004.3-202ENST00000445883 451 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
TCOF1Q13428 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
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