Protein–RNA interactions for Protein: O60934

NBN, Nibrin, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBNO60934 AL645939.3-201ENST00000435408 225 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
NBNO60934 Z98949.3-201ENST00000436423 472 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
NBNO60934 AC108066.1-201ENST00000437261 596 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
NBNO60934 PIK3IP1-AS1-201ENST00000440456 554 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
NBNO60934 SNRPBP1-201ENST00000443634 282 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
NBNO60934 RARRES2P3-201ENST00000457739 473 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
NBNO60934 FOXP1-AS1-201ENST00000465742 700 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
NBNO60934 SELENOT-204ENST00000480740 783 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
NBNO60934 AC005017.1-201ENST00000482002 490 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
NBNO60934 MTND3P6-201ENST00000485242 339 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
NBNO60934 AC093870.1-201ENST00000506837 213 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
NBNO60934 AC078922.1-201ENST00000547547 434 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
NBNO60934 AL161757.3-201ENST00000555316 807 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
NBNO60934 AL133371.1-201ENST00000555481 764 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
NBNO60934 AC011468.1-201ENST00000569091 675 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
NBNO60934 AC091133.5-201ENST00000603088 301 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
NBNO60934 AC138473.1-201ENST00000605717 526 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
NBNO60934 AC073389.3-201ENST00000609434 935 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
NBNO60934 AC243571.1-201ENST00000615743 478 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
NBNO60934 Metazoa_SRP.129-201ENST00000619776 251 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
NBNO60934 SLC35A1-205ENST00000622775 1206 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
NBNO60934 AL035425.4-201ENST00000624509 1063 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
NBNO60934 NRCAM-204ENST00000379028 6685 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
NBNO60934 SLC9A4-201ENST00000295269 4138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
NBNO60934 CD86-209ENST00000493101 1572 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
NBNO60934 AC106799.3-201ENST00000562127 3300 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
NBNO60934 ZNF841-202ENST00000426391 3620 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
NBNO60934 CAST-228ENST00000509903 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
NBNO60934 TMEM75-201ENST00000624314 2165 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
NBNO60934 ATF7IP-222ENST00000544627 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
NBNO60934 MROH9-201ENST00000367758 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
NBNO60934 PDE1C-203ENST00000396184 8852 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
NBNO60934 KCNMA1-266ENST00000639601 11920 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
NBNO60934 NSUN4-208ENST00000498008 3867 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
NBNO60934 PSG1-203ENST00000403380 1722 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
NBNO60934 IFIT1P1-201ENST00000400497 1449 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
NBNO60934 AADACL3-201ENST00000359318 3662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
NBNO60934 CATSPER2-202ENST00000381761 1758 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
NBNO60934 LINC01751-201ENST00000569178 1770 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
NBNO60934 CDH18-205ENST00000506372 2432 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
NBNO60934 ZFP62-201ENST00000502412 3415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
NBNO60934 AC018992.1-201ENST00000523778 2149 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
NBNO60934 LINC00517-202ENST00000554257 3460 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
NBNO60934 PIK3C3-202ENST00000398870 9206 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
NBNO60934 DNAH10-210ENST00000638045 13678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
NBNO60934 ZNF160-208ENST00000599056 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
NBNO60934 ANKRD31-201ENST00000274361 6036 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
NBNO60934 USP16-203ENST00000399975 2960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
NBNO60934 JAM3-202ENST00000441717 3363 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
NBNO60934 CD2-202ENST00000369478 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
NBNO60934 CCL2-201ENST00000225831 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
NBNO60934 PPIAP24-201ENST00000328558 471 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
NBNO60934 UQCR10-201ENST00000330029 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
NBNO60934 MRAP-202ENST00000339944 440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
NBNO60934 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
NBNO60934 KRTAP3-1-201ENST00000391588 594 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
NBNO60934 PRELID1P1-201ENST00000403549 660 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
NBNO60934 AC007091.1-201ENST00000412563 566 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
NBNO60934 AC009229.2-201ENST00000417213 351 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
NBNO60934 GPN3P1-201ENST00000423883 535 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
NBNO60934 LINC00433-201ENST00000424165 888 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
NBNO60934 AC097523.2-201ENST00000435551 652 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
NBNO60934 GAPDHP59-201ENST00000435908 267 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
NBNO60934 POU5F1P5-201ENST00000445059 658 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
NBNO60934 ENTPD3-AS1-204ENST00000452768 724 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
NBNO60934 TRBV8-1-201ENST00000481590 279 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
NBNO60934 PTTG2-201ENST00000504686 691 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
NBNO60934 AC113367.2-201ENST00000505749 160 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
NBNO60934 AC091819.1-201ENST00000518330 630 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
NBNO60934 BLID-201ENST00000560104 862 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
NBNO60934 AC018767.3-201ENST00000564185 481 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
NBNO60934 AP005202.2-201ENST00000582386 658 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
NBNO60934 AC023421.2-202ENST00000586213 547 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
NBNO60934 AC092944.2-201ENST00000605443 889 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
NBNO60934 RN7SL261P-201ENST00000613441 282 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
NBNO60934 AC073488.2-201ENST00000631903 751 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
NBNO60934 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
NBNO60934 CTNND1-218ENST00000528232 5745 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
NBNO60934 LINC01559-201ENST00000318426 2750 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
NBNO60934 RSRC1-203ENST00000464171 2411 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
NBNO60934 BMPR2-202ENST00000374580 11461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
NBNO60934 BTN3A2-205ENST00000508906 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
NBNO60934 THRB-IT1-201ENST00000425296 1754 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
NBNO60934 ADGRL3-204ENST00000506720 4962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
NBNO60934 UPF2-203ENST00000397053 5369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
NBNO60934 KIAA0232-202ENST00000425103 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
NBNO60934 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
NBNO60934 CXCR6-202ENST00000438735 2242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
NBNO60934 OAS2-202ENST00000392583 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
NBNO60934 CD53-201ENST00000271324 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
NBNO60934 API5P1-201ENST00000424316 1510 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
NBNO60934 CLEC12A-205ENST00000434319 1515 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
NBNO60934 PRLR-212ENST00000513753 1525 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
NBNO60934 STXBP5-203ENST00000367480 3297 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
NBNO60934 NOX1-202ENST00000372960 2418 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
NBNO60934 UVRAG-205ENST00000528420 2463 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
NBNO60934 ZNF521-203ENST00000538137 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
NBNO60934 LTA4H-209ENST00000552789 2025 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
NBNO60934 CLSTN2-201ENST00000458420 14202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
NBNO60934 C18orf54-206ENST00000620105 5693 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms