Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
BIVM-ERCC5R4GMW8 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
BIVM-ERCC5R4GMW8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
BIVM-ERCC5R4GMW8 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
BIVM-ERCC5R4GMW8 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
BIVM-ERCC5R4GMW8 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
BIVM-ERCC5R4GMW8 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
BIVM-ERCC5R4GMW8 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
BIVM-ERCC5R4GMW8 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
BIVM-ERCC5R4GMW8 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC33.37■■■□□ 2.93
BIVM-ERCC5R4GMW8 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
BIVM-ERCC5R4GMW8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
BIVM-ERCC5R4GMW8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
BIVM-ERCC5R4GMW8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
BIVM-ERCC5R4GMW8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
BIVM-ERCC5R4GMW8 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
BIVM-ERCC5R4GMW8 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
BIVM-ERCC5R4GMW8 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
BIVM-ERCC5R4GMW8 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
BIVM-ERCC5R4GMW8 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
BIVM-ERCC5R4GMW8 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
BIVM-ERCC5R4GMW8 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
BIVM-ERCC5R4GMW8 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
BIVM-ERCC5R4GMW8 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
BIVM-ERCC5R4GMW8 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
BIVM-ERCC5R4GMW8 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
BIVM-ERCC5R4GMW8 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
BIVM-ERCC5R4GMW8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
BIVM-ERCC5R4GMW8 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
BIVM-ERCC5R4GMW8 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
BIVM-ERCC5R4GMW8 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
BIVM-ERCC5R4GMW8 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
BIVM-ERCC5R4GMW8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
BIVM-ERCC5R4GMW8 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
BIVM-ERCC5R4GMW8 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
BIVM-ERCC5R4GMW8 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
BIVM-ERCC5R4GMW8 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
BIVM-ERCC5R4GMW8 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
BIVM-ERCC5R4GMW8 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
BIVM-ERCC5R4GMW8 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
BIVM-ERCC5R4GMW8 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
BIVM-ERCC5R4GMW8 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
BIVM-ERCC5R4GMW8 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
BIVM-ERCC5R4GMW8 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
BIVM-ERCC5R4GMW8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
BIVM-ERCC5R4GMW8 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.93
BIVM-ERCC5R4GMW8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
BIVM-ERCC5R4GMW8 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
BIVM-ERCC5R4GMW8 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
BIVM-ERCC5R4GMW8 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
BIVM-ERCC5R4GMW8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
BIVM-ERCC5R4GMW8 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
BIVM-ERCC5R4GMW8 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
BIVM-ERCC5R4GMW8 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
BIVM-ERCC5R4GMW8 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
BIVM-ERCC5R4GMW8 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
BIVM-ERCC5R4GMW8 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
BIVM-ERCC5R4GMW8 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
BIVM-ERCC5R4GMW8 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
BIVM-ERCC5R4GMW8 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
BIVM-ERCC5R4GMW8 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
BIVM-ERCC5R4GMW8 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
BIVM-ERCC5R4GMW8 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
BIVM-ERCC5R4GMW8 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
BIVM-ERCC5R4GMW8 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
BIVM-ERCC5R4GMW8 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
BIVM-ERCC5R4GMW8 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
BIVM-ERCC5R4GMW8 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
BIVM-ERCC5R4GMW8 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
BIVM-ERCC5R4GMW8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
BIVM-ERCC5R4GMW8 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
BIVM-ERCC5R4GMW8 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
BIVM-ERCC5R4GMW8 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
BIVM-ERCC5R4GMW8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
BIVM-ERCC5R4GMW8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
BIVM-ERCC5R4GMW8 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
BIVM-ERCC5R4GMW8 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
BIVM-ERCC5R4GMW8 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
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