Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D6

ARFGEF1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF1Q9Y6D6 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ARFGEF1Q9Y6D6 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms