Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5M8

SRPRB, Signal recognition particle receptor subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRBQ9Y5M8 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SRPRBQ9Y5M8 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRPRBQ9Y5M8 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms