Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NRXN3Q9Y4C0 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
NRXN3Q9Y4C0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NRXN3Q9Y4C0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NRXN3Q9Y4C0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NRXN3Q9Y4C0 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
NRXN3Q9Y4C0 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NRXN3Q9Y4C0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NRXN3Q9Y4C0 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NRXN3Q9Y4C0 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NRXN3Q9Y4C0 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NRXN3Q9Y4C0 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NRXN3Q9Y4C0 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
NRXN3Q9Y4C0 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NRXN3Q9Y4C0 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NRXN3Q9Y4C0 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NRXN3Q9Y4C0 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NRXN3Q9Y4C0 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NRXN3Q9Y4C0 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NRXN3Q9Y4C0 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NRXN3Q9Y4C0 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NRXN3Q9Y4C0 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NRXN3Q9Y4C0 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NRXN3Q9Y4C0 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NRXN3Q9Y4C0 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NRXN3Q9Y4C0 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NRXN3Q9Y4C0 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NRXN3Q9Y4C0 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NRXN3Q9Y4C0 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
NRXN3Q9Y4C0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NRXN3Q9Y4C0 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NRXN3Q9Y4C0 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NRXN3Q9Y4C0 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NRXN3Q9Y4C0 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NRXN3Q9Y4C0 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NRXN3Q9Y4C0 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NRXN3Q9Y4C0 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
NRXN3Q9Y4C0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NRXN3Q9Y4C0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NRXN3Q9Y4C0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NRXN3Q9Y4C0 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
NRXN3Q9Y4C0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NRXN3Q9Y4C0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NRXN3Q9Y4C0 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NRXN3Q9Y4C0 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
NRXN3Q9Y4C0 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
NRXN3Q9Y4C0 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NRXN3Q9Y4C0 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
NRXN3Q9Y4C0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NRXN3Q9Y4C0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NRXN3Q9Y4C0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NRXN3Q9Y4C0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NRXN3Q9Y4C0 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NRXN3Q9Y4C0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms