Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B6

DCAF1, DDB1- and CUL4-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF1Q9Y4B6 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
DCAF1Q9Y4B6 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
DCAF1Q9Y4B6 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
DCAF1Q9Y4B6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
DCAF1Q9Y4B6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
DCAF1Q9Y4B6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
DCAF1Q9Y4B6 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
DCAF1Q9Y4B6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
DCAF1Q9Y4B6 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
DCAF1Q9Y4B6 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
DCAF1Q9Y4B6 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
DCAF1Q9Y4B6 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC38.33■■■■□ 3.73
DCAF1Q9Y4B6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
DCAF1Q9Y4B6 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
DCAF1Q9Y4B6 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC38.32■■■■□ 3.73
DCAF1Q9Y4B6 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
DCAF1Q9Y4B6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
DCAF1Q9Y4B6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
DCAF1Q9Y4B6 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
DCAF1Q9Y4B6 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.72
DCAF1Q9Y4B6 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.72
DCAF1Q9Y4B6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
DCAF1Q9Y4B6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
DCAF1Q9Y4B6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.72
DCAF1Q9Y4B6 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.72
DCAF1Q9Y4B6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
DCAF1Q9Y4B6 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
DCAF1Q9Y4B6 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
DCAF1Q9Y4B6 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
DCAF1Q9Y4B6 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
DCAF1Q9Y4B6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
DCAF1Q9Y4B6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
DCAF1Q9Y4B6 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC38.31■■■■□ 3.72
DCAF1Q9Y4B6 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.31■■■■□ 3.72
DCAF1Q9Y4B6 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
DCAF1Q9Y4B6 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
DCAF1Q9Y4B6 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC38.31■■■■□ 3.72
DCAF1Q9Y4B6 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
DCAF1Q9Y4B6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
DCAF1Q9Y4B6 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
DCAF1Q9Y4B6 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
DCAF1Q9Y4B6 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
DCAF1Q9Y4B6 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC38.3■■■■□ 3.72
DCAF1Q9Y4B6 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
DCAF1Q9Y4B6 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
DCAF1Q9Y4B6 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC38.3■■■■□ 3.72
DCAF1Q9Y4B6 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
DCAF1Q9Y4B6 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
DCAF1Q9Y4B6 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
DCAF1Q9Y4B6 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
DCAF1Q9Y4B6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
DCAF1Q9Y4B6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
DCAF1Q9Y4B6 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
DCAF1Q9Y4B6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
DCAF1Q9Y4B6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
DCAF1Q9Y4B6 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
DCAF1Q9Y4B6 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
DCAF1Q9Y4B6 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC38.29■■■■□ 3.72
DCAF1Q9Y4B6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
DCAF1Q9Y4B6 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
DCAF1Q9Y4B6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
DCAF1Q9Y4B6 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
DCAF1Q9Y4B6 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
DCAF1Q9Y4B6 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC38.28■■■■□ 3.72
DCAF1Q9Y4B6 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
DCAF1Q9Y4B6 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
DCAF1Q9Y4B6 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
DCAF1Q9Y4B6 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
DCAF1Q9Y4B6 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
DCAF1Q9Y4B6 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
DCAF1Q9Y4B6 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
DCAF1Q9Y4B6 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
DCAF1Q9Y4B6 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
DCAF1Q9Y4B6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
DCAF1Q9Y4B6 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.27■■■■□ 3.72
DCAF1Q9Y4B6 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
DCAF1Q9Y4B6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
DCAF1Q9Y4B6 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
DCAF1Q9Y4B6 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
DCAF1Q9Y4B6 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
DCAF1Q9Y4B6 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
DCAF1Q9Y4B6 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
DCAF1Q9Y4B6 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
DCAF1Q9Y4B6 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
DCAF1Q9Y4B6 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
DCAF1Q9Y4B6 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
DCAF1Q9Y4B6 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
DCAF1Q9Y4B6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
DCAF1Q9Y4B6 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
DCAF1Q9Y4B6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
DCAF1Q9Y4B6 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
DCAF1Q9Y4B6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
DCAF1Q9Y4B6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
DCAF1Q9Y4B6 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
DCAF1Q9Y4B6 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC38.26■■■■□ 3.72
DCAF1Q9Y4B6 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.72
DCAF1Q9Y4B6 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC38.26■■■■□ 3.72
DCAF1Q9Y4B6 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.71
DCAF1Q9Y4B6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
DCAF1Q9Y4B6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms