Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMED7Q9Y3B3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms