Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYNPO2Q9UMS6 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYNPO2Q9UMS6 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms