Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB23Q9ULC3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAB23Q9ULC3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAB23Q9ULC3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAB23Q9ULC3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB23Q9ULC3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB23Q9ULC3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB23Q9ULC3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB23Q9ULC3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB23Q9ULC3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB23Q9ULC3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB23Q9ULC3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB23Q9ULC3 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB23Q9ULC3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB23Q9ULC3 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB23Q9ULC3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB23Q9ULC3 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB23Q9ULC3 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB23Q9ULC3 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB23Q9ULC3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB23Q9ULC3 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB23Q9ULC3 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB23Q9ULC3 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB23Q9ULC3 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB23Q9ULC3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB23Q9ULC3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB23Q9ULC3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB23Q9ULC3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB23Q9ULC3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB23Q9ULC3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB23Q9ULC3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB23Q9ULC3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB23Q9ULC3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB23Q9ULC3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB23Q9ULC3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB23Q9ULC3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB23Q9ULC3 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB23Q9ULC3 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB23Q9ULC3 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB23Q9ULC3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB23Q9ULC3 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB23Q9ULC3 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB23Q9ULC3 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB23Q9ULC3 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB23Q9ULC3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB23Q9ULC3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB23Q9ULC3 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB23Q9ULC3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB23Q9ULC3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB23Q9ULC3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB23Q9ULC3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB23Q9ULC3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB23Q9ULC3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB23Q9ULC3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB23Q9ULC3 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB23Q9ULC3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB23Q9ULC3 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB23Q9ULC3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB23Q9ULC3 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB23Q9ULC3 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB23Q9ULC3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB23Q9ULC3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB23Q9ULC3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB23Q9ULC3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB23Q9ULC3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RAB23Q9ULC3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RAB23Q9ULC3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms