Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK80

USP21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21Q9UK80 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP21Q9UK80 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
USP21Q9UK80 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP21Q9UK80 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP21Q9UK80 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP21Q9UK80 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP21Q9UK80 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
USP21Q9UK80 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP21Q9UK80 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP21Q9UK80 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
USP21Q9UK80 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP21Q9UK80 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP21Q9UK80 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP21Q9UK80 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP21Q9UK80 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP21Q9UK80 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP21Q9UK80 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP21Q9UK80 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP21Q9UK80 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP21Q9UK80 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP21Q9UK80 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
USP21Q9UK80 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP21Q9UK80 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
USP21Q9UK80 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
USP21Q9UK80 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP21Q9UK80 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP21Q9UK80 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP21Q9UK80 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
USP21Q9UK80 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP21Q9UK80 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP21Q9UK80 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP21Q9UK80 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP21Q9UK80 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP21Q9UK80 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP21Q9UK80 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP21Q9UK80 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP21Q9UK80 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP21Q9UK80 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP21Q9UK80 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP21Q9UK80 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
USP21Q9UK80 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP21Q9UK80 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP21Q9UK80 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP21Q9UK80 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP21Q9UK80 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
USP21Q9UK80 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP21Q9UK80 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP21Q9UK80 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP21Q9UK80 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP21Q9UK80 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP21Q9UK80 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
USP21Q9UK80 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP21Q9UK80 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
USP21Q9UK80 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP21Q9UK80 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
USP21Q9UK80 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP21Q9UK80 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
USP21Q9UK80 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP21Q9UK80 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP21Q9UK80 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP21Q9UK80 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP21Q9UK80 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP21Q9UK80 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP21Q9UK80 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP21Q9UK80 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP21Q9UK80 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
USP21Q9UK80 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP21Q9UK80 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP21Q9UK80 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
USP21Q9UK80 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP21Q9UK80 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP21Q9UK80 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
USP21Q9UK80 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP21Q9UK80 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP21Q9UK80 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP21Q9UK80 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
USP21Q9UK80 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
USP21Q9UK80 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
USP21Q9UK80 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
USP21Q9UK80 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
USP21Q9UK80 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
USP21Q9UK80 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
USP21Q9UK80 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP21Q9UK80 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP21Q9UK80 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP21Q9UK80 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP21Q9UK80 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
USP21Q9UK80 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP21Q9UK80 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP21Q9UK80 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP21Q9UK80 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
USP21Q9UK80 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP21Q9UK80 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP21Q9UK80 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP21Q9UK80 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP21Q9UK80 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP21Q9UK80 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
USP21Q9UK80 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP21Q9UK80 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
USP21Q9UK80 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms