Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VAX2Q9UIW0 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
VAX2Q9UIW0 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms