Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SCN11AQ9UI33 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCN11AQ9UI33 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.8 ms