Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRP68Q9UHB9 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms