Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIPSNAP3AQ9UFN0 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIPSNAP3AQ9UFN0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIPSNAP3AQ9UFN0 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIPSNAP3AQ9UFN0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIPSNAP3AQ9UFN0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIPSNAP3AQ9UFN0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIPSNAP3AQ9UFN0 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIPSNAP3AQ9UFN0 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIPSNAP3AQ9UFN0 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NIPSNAP3AQ9UFN0 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIPSNAP3AQ9UFN0 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIPSNAP3AQ9UFN0 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIPSNAP3AQ9UFN0 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIPSNAP3AQ9UFN0 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIPSNAP3AQ9UFN0 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NIPSNAP3AQ9UFN0 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NIPSNAP3AQ9UFN0 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms